陈耀东否认涉案，但叶丽珍坦承，供称陈耀东指示她复制档案，而且收贿时陈也在场。检察官认为陈耀东没有悔意，求刑10年;叶丽珍缴回20多万元(新台币，下同)犯罪所得，检方请法官从轻量刑。
承办检察官于知庆指出，故宫博物院从2001年起，将珍贵文物数据制成数字文件，让院藏文物永续保存;陈、叶女不但收贿，还利用台北故宫内控机制不完备，擅自复制留存，幸及时查获。
检方清查被复制的图档，部分是合法或公务使用、部分是申请后未归还;但包括龙藏经、永乐大典、明金刚经及富春山居图、董其昌心经等台北故宫数位典藏文物，都被复制，虽然没证据显示档案已外流，但检方怀疑他们复制动机。
起诉指出，台北故宫2006年欲印制发行龙藏经，指派陈耀东及叶丽珍负责招标事宜。2009年3、4月，得标厂商龙冈公司将打样稿送台北故宫校对后，未如期归还，赵姓负责人行贿陈耀东50万元，希望加速作业。
前年初，叶丽珍与龙冈雇用的分色师口角，要求更换分色师，赵唯恐影响印制进度，再行贿陈、叶女各20万元。
龙藏经出版后，依约回馈台北故宫31套龙藏经。其中23套回馈给出版计划赞助人直贡姜贡法王澈赞仁波切，运费由龙冈负责;但陈、叶以却以不实报价单，向台北故宫诈领45000元运费。
检方指出，台北故宫保存的“景印康熙间内府泥金写本龙藏经(甘珠尔)”是清朝康熙皇帝在康熙八年，征专人以泥金方式用藏文书写，绘有精美佛像图画，全书以贝叶经推蓬装方式，每函约448叶，共108函，极具价值。