谜团一“贵妃遗体”新旧唐书记载不同，新唐书只说香囊犹在。
公元756年，一场声势浩大的“安史之乱”促使大唐王朝由盛转衰。叛军攻入长安时，唐玄宗连夜出逃。第二天，逃亡队伍到达陕西境内的马嵬坡。随行将士突然起义，当朝宰相杨国忠瞬间死于乱军之中。随后，他们把矛头指向杨国忠的姐姐——杨贵妃。
就在这年夏天的一个夜晚，几个神秘人忽然出现在马嵬坡上。他们悄悄挖开贵妃的坟墓，他们究竟在找什么？史料记载玄宗皇帝回长安后，秘密令宦官改葬贵妃，但是去改葬的人回来却说不见了贵妃的遗体，只带回了贵妃生前携带的香囊。
关于神秘挖墓事件，新旧唐书有两种不同记载。旧唐书里说：肌肤已坏，而香囊犹在。而新唐书里却只有：香囊犹在。新旧唐书为何有差异？贵妃的遗体是否被盗墓人盗走了？
但这样的说法似乎很难成立，危急时刻，民间的人不会很快得知贵妃埋葬的地方。而且倘是盗墓分子所为，就不会留下香囊。那么，新旧唐书哪个记载更准确？旧唐书是唐朝时就记载的，而新唐书是宋朝人根据旧唐书编写的，按常理说应该是旧唐书尤为可信，但如果是这样，新唐书里也不该将“肌肤已坏”如此重要的记载删掉。
中国人民大学历史系刘厚滨教授认为，从唐明皇本人角度来看，他肯定要对外宣布贵妃已死。可如果现在这样记载，就给人一个想像空间。宋朝人在写新唐书时，干脆就不说有没有尸体，就把这事给回避了。
谜团二 四川都江堰挖出装女人的小巧棺木， 但墓主人身份难定。
1000多年后的今天，在法门寺博物馆内，记者见到了这个富有传奇色彩的香囊。这种香囊在古代称做“香球”。据宋馆长介绍，在香囊里有两个持平环，里面有一个小钵盂，无论怎样转动，这个钵盂始终与地面保持平行，里面的香料始终不会洒落出来。
而今在马嵬镇上，重新修葺的杨贵妃墓馆里不仅有贵妃的墓，还有塑像。现今修葺的墓有3米高，外形用青砖包砌得很严实，原始贵妃墓不可能有这样包砌的青砖。在疑惑无法解答时，四川都江堰市的红梅村传出了千年古墓的奇闻。传说，这个村子后山脚的一座千年古墓是杨贵妃的墓。
据村民讲，早年在这里的墓碑上刻着杨字，却没有名讳，这个有千年历史的墓是一个暗墓。那块墓碑在“文革”时期已不存在，而今墓地也被种上了庄稼，只有一块破陋的祭台青砖还留着。
1997年，市里和红梅村联合对该墓实行挖掘。挖出的棺木长仅1.7米，宽仅45厘米，无疑是装女人的棺木，但墓主人身份很难判断。
谜团三 日本民间盛传杨贵妃逃到日本， 《长恨歌》中也曾暗示。
2002年，日本影星山口百惠声明，她是杨贵妃的后裔。这个消息让中国人无比震惊，杨贵妃的后人怎么可能跑到日本去呢？其实早在20年代，着名“红学家”俞平伯先生在《长恨歌》等文章中指出，杨贵妃可能并没死在马嵬坡，而是去了日本定居。现今的日本沿海边有一个叫做“久津”的村子，以“杨贵妃之乡”而闻名。
传说，当年杨贵妃在马嵬坡兵变下，一名侍女代她死了，杨贵妃在遣唐使的帮助下，乘船离开大唐，经过漫长漂泊，到了日本山口县久津，而山口百惠就是山口家族的一员。日本南宫博的《杨贵妃外传》和渡边龙策的《杨贵妃复活秘史》中也有描述。难道杨贵妃真逃去了日本？着名比较文学专家严绍焘认为，这跟白居易的《长恨歌》有关，白居易在诗的后半部分表述了对杨贵妃的一种想像，说杨贵妃虽然在事变中人已死，但她的灵魂飘到神仙山上，后来和唐明皇派去的道士在神仙山上相遇了。而众所周知，《长恨歌》描写的是杨贵妃和唐玄宗的爱情。
人们分析长恨歌里写的诗句，“马嵬坡下泥土中，不见玉颜空死处”。其中“不见玉颜空死处”就是描写了马嵬坡上找不到杨贵妃的遗体了。而此后唐玄宗派一个道士去找寻杨贵妃，结果“上穷碧落下黄泉”都没找到，最后道士在仙山上找到了贵妃。倘若道士真在仙山上找到了贵妃，这里写到的蓬莱仙山又在哪里？在日本的文学创作中，他们常常把蓬莱山本身就指为日本。